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４人しか居ないのに既読４と表示されるなど、「LINEの既読数がおかしい」ということは良くあります。ただ、現在特に既読数が多すぎたり、不安定だったりと問題が少し多いようなので、ここに書いておきます。
※2014年7月11日12:30ごろより、一部ユーザーの間で再び問題が発生している模様です（継続中@7/12 10:00）。最新情報：【LINE】既読数が多く表示される不具合と安否確認としての性質 | LINEの仕組み（2014年7月11日）
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症状の例
主に症状は、既読数が多い・不安定（例：「３人なのに既読４になっている」「３人なのに既読３」「２人なのに既読２」「４人なのに既読５」など）というもので、次のような報告例があります。
うち入れて4人でLINEしてるのに既読が5になってるw
— たけはら@ユリウスさん (@tomieel) 11月 5, 2012LINEこわいんじゃけど。４人しかおらんのに既読６になる((((；ﾟДﾟ)))))))
— あーちゃんさん (@azu26_) 11月 5, 2012LINEで、4人のグループなのに、私の発言に既読4がついた…なんだよーー1人多いよーー(;_; )
— Yurinaさん (@645Y) 11月 5, 2012３人しかおらんLINEグループやから、既読２までのはずやのに、既読４とかになってる！！笑こわたん。笑
— みずきさん (@miiizk21) 11月 5, 2012lineの既読数が明らかにおかしいのがいっぱいある。前後既読35に、既読28が挟まれてたりする。ほわい？
— ゆうらりしょーたさん (@yuurari48) 11月 5, 20122014年7月11日発生分
グループが五人のLINEなのに既読が8になってて怖い
— mzk (@mizikondoria) 2014, 7月 11三人のグループLINEなのに既読4ついてる…あと二人だれ
— ふみなし (@Tp731Fmn) 2014, 7月 11LINEバグった！グループで21人しかいないのに既読28になってる！笑笑
— tasato (@haruka0217_t) 2014, 7月 11ホルンLINE既読4
え、だれ（笑）（笑） pic.twitter.com/J8MAhOfRYR
— ほ の か (@_____hrcg) 2014, 7月 112TAのLINE、31人しか入ってへんのに
既読56ついてんねんけど。
なにこれ、こわい笑笑
— みつき (@mtkgrgr) 2014, 7月 11注意すべき点
とにかく、現実問題既読数が多くなることは良くあることに加え、仕組み的にも考えられる現象なので、あまり気にせずに、不気味に思ったりもせず、あまり考えすぎないように、間違えもあるんだと思って「既読」という機能を使うようにした方が良いと思います。
注意すべき点としては、たとえば４人のグループで、２人が読んだときに、間違えて既読３と表示してしまった場合、本当は２人しか読んでいないのに、もう１人が読んだと思ってしまい、「なんで読んだのに返事くれないの！」と思ってしまうことです。実際に既読○○人と表示されたときは、「読んでいる人数が多くても○○人」と読むのが無難なのかもしれませんね^^;
また、表示されていない誰か知らない人がグループトークに参加しているんじゃないか、と変に疑う必要もないと思います。
原因はわからないけれど
このはっきりとした原因は分かりませんが、既読数の計測方法がゆるいのだと思います。
「誰が読んだか」という「読んだ人の一覧」を管理していないということは予想できます。つまり、既読数を増やす操作に冪等性（アイデンポーテント性）がないんだろうな、と。例えば既読の数をインクリメント（１増やす操作）として実装していた場合、「読んだよ」というメッセージを何度も送信してしまい、それらの区別を付けないと、実際の人数以上にインクリメントしてしまう可能性があります。このような、同じ操作（読んだよというメッセージの送信）が複数回実行されたときに、１回実行したときと結果が変わってしまうことを冪等性が無い、と言い、この場合、既読数が多すぎになってしまったりすることが考えられるわけです。
このインクリメント操作は、もともと難しい作業に分類されているので、負荷を抑えるため・大量のトラフィックをさばくために、そもそも厳密な動作が必要ないように実装しているのだと思います。まぁ、想像ですけど；
追記
よくよく観察してみると、「既読数がおかしい」と言っている人はiPhoneユーザが多い気がします。また、本日iPhone版LINEにアップデートがあり、そのことと関係しているかもしれません。
追記２（2012-11-07）
LINE公式アカウントが、Twitterにおける個人宛リプライにて、「不具合である」と述べています。
ですので、誰かに見られているのではないかと心配している人も多いのですが、やはりそういうわけではなさそうです。
既読数が合致しない問題はLINE側の不具合で、誰かに見られているというわけではありいません。現在、修正対応をしておりますので近日中に直る予定ですのでいましばらくお待ち下さい。申し訳ありません。 （引用元）
コメント募集中（2014/7/12開始）
この記事のコメント欄では、「○○人のグループなのに、既読数が△△と表示された」という体験情報を募集中です。気軽にコメントしてください（システムの都合上、メアド入力が必要ですが、example@example.com でOKです）。
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2014年7月12日(土) 17:50
ライングループ8人で既読11，別のグループは23人で既読25発生中・・・
@iPhone
2014年7月12日(土) 18:14
LINEグループ人数5人既読7発生
@AQUEOUS PHONE sh-12c
2014年7月13日(日) 08:34
家族四人なのに既読5になってて!!!!!!
他人2人に読まれてると思うと恐ーーい
夜も不安で眠れない。
娘が情報調べてくれたので一安心(^_^)
こんな事もあるんですね
2014年7月13日(日) 08:34
LINE 5人グループで 私は既読6、もう1人は既読7が、出ています。
@iPhone5
2014年7月13日(日) 10:17
グループ4人なのに、既読5とか6とか出ます。iPhoneに多いようですが、私はiPadです。
2014年7月13日(日) 12:09
グループ３人で既読３
2014年7月13日(日) 17:09
10人グループで既読14の友達がいます。なお同じグループで私は既読8でした。どちらもiPhoneユーザーです
2014年7月13日(日) 22:32
昨日のラインだけ４人グループで普通多くて既読３のところ既読５でした。
アンドロイドのネクサス７のタブレットです。
2014年7月22日(火) 18:10
4人グループで既読5、2人グループで既読3発生中。
機種はAndroidです。
2014年7月25日(金) 13:54
7/24 13人グループで 既読14 , 既読16
発生したのは 私だけ 機種はiPadです。
2014年8月26日(火) 07:37
グループ6人なのに既読22はおかしすぎるwwww
めっちゃ笑ったわ
2014年8月29日(金) 12:20
24人グループなのに既読が25、26になってるー！
あたし以外の23人は普通に表示されるらしい・・・。
2014年10月28日(火) 00:08
5人グループで、既読数が6だったり、7っだったり時には8だったり不思議におっもてたら、他でも起きてる事なのね
2014年11月4日(火) 14:31
36人のグループやのに既読63てどゆこと笑
2014年11月28日(金) 20:10
10月中旬から5人グループで
既読数が6ついたことが続き
不安と気持ち悪さからグループを削除。
11月21日に新しくグループ作成。
同じく5人グループで
既読数が最大13となった。
不具合だとLINE側は言うが
LINE乗っ取りなのではと不安になるため
早く改善してしい
2014年11月30日(日) 21:34
グループ投稿で既読7になるはずなのに9、10と表示されました。何日か経つと既読7に戻りました。
機種はAndroidです。
2015年3月27日(金) 16:01
友達のLINEで6人でやってる筈なのに
既読6と出たそうです。
2016年1月10日(日) 23:55
招待されたグループの人数が2なのに
既読数が40に…
でもそのグループで話してる人は
自分を含めて4人は少なくともいます…
どういうことなのでしょう…